学校肇始于1912年，前身为留美归国、著名医学教育家颜福庆先生创立的长沙红十字会看护训练所，1924年正式建立长沙仁术护病学校。1961年从长沙搬迁至安江建立黔阳地区卫生学校，1984年搬迁至怀化并更名为怀化地区卫生学校。2000年3月，升格为怀化医学高等专科学校。2014年5月，经教育部批准升格并更名为湖南医药学院。

学校占地面积1418亩，校舍建筑面积26.8万㎡，现有教学科研仪器设备总值9342万元，图书馆馆藏纸质图书77万册，中外文纸质期刊578种，电子图书157万册。

学校设有医学院、药学院、护理学院、康复医学与保健学院、检验医学院、口腔医学院、医学人文与管理学院、马克思主义学院、国际教育学院、计算机科学教学研究部、体育教学研究部、继续教育学院。

学校是国家执业医师临床类别实践技能考试基地，有国家三级甲等综合性直属附属医院（临床学院）1所、非直属附属医院（临床学院）7所。其中，第一附属医院占地面积17.9万㎡，编制病床1200张，有心血管内科、呼吸内科、护理学3个省级临床重点建设专科，是国家新药临床试验机构和湖南省慢阻肺同质化培训基地。非直属附属医院包括国家三级甲等综合医院5所、国家三级甲等中医医院1所和国家三级专科医院1所，编制床位10400张。