南京中医药大学翰林学院始建于2002年3月，2005年5月被教育部批准为独立学院。2010年9月，学院移址素有“文昌水秀，祥泰之州”之誉的苏中历史名城泰州市办学，坐落在国家医药高新技术产业开发区内，为首家进驻中国医药城的全日制本科院校，也是全省高等教育综合改革试点独立学院之一。
多年来，学院建设了一支以南京中医药大学教师为骨干，专任教师为基础的专兼结合、高素质、高水平的优秀师资队伍，聘请了在中国医药城工作的全国“千人计划”14位高级专家为特聘教授。学院致力于培养具有国际竞争能力的应用型、复合型、创新型高级人才，积极探索和创新产学研一体化办学模式，狠抓内涵建设，努力提升教学质量，优化师资队伍结构，逐步改善办学条件，不断创新管理体制机制，内部运行规范高效，形成了体现时代特征、医药特色、“校”“城”融合、重应用能力的人才培养格局。学院现设有中医学、针灸推拿学、护理学、应用心理、中药学、药学、生物制药、制药工程、药物制剂、中药资源与开发、药事管理、公共事业管理、国际经济与贸易、市场营销、信息管理和信息系统等15个本科专业，具有相关专业独立的学士学位授予权、高校教师资格认定权和高校教师中级职称自评权。