学校创建于1947年,前身为大连医学院，是抗日战争胜利后中国共产党创办的第一所医学本科院校。1953年成为原卫生部直属高校，上世纪六十年代中期为服从国家“三线”建设战略和支援贵州建设，根据国务院的决定，学校整体搬迁至贵州省遵义市，更名为遵义医学院。2016年成为国家卫生和计划生育委员会与贵州省人民政府共建高校。在教育部本科教学工作水平评估中获得“优秀”,并顺利通过教育部本科教学工作审核评估。是国家首批卓越医生教育培养计划项目试点高校。经过70年的建设与发展，已成为以医学为主，文理渗透的多学科、多层次、办学特色鲜明、办学实力雄厚的省属高校。
学校占地面积2500多亩，有全日制在校生16000多人，下设28个教学院系、4所直属附属医院、9所非直属附属医院。
建校以来，学校群英荟萃、专家云集，中国科学院学部委员吴汝康、魏曦、沈其震、杨简，中国科学院院士薛社普、吴新智，药理学家张毅、生物学家伍律等知名专家学者曾执教讲坛。学校现有专任教师1055人，二级教授12人，具有副高级专业技术职务以上的专任教师777人；具有博士、硕士学位人数为961人，硕士生导师703人，兼职博士生导师10人。教师队伍中有1人入选第三批国家“万人计划”科技创新领军人才，享受国务院和省政府特殊津贴专家50人，全国优秀教师4人，全国模范教师2人，全国先进工作者2人，全国师德先进个人2人，全国优秀科技工作者2人，国家创新人才推进计划中青年科技创新领军人才1人，卫生部有突出贡献专家3人，全国高等学校先进科技工作者1人，教育部新世纪优秀人才7人，贵州省核心专家2人，省管专家26人，贵州省各类优秀人才67人次；教育部高等学校教学指导委员会委员4名。
学校本科教育涵盖医学、理学、工学、教育学、管理学、文学等6个学科门类，包含29个本科专业。学校从1955年开始招收研究生，是国务院学位委员会批准的首批硕士学位授权单位。目前，研究生教育涵盖医学、理学、法学、管理学等4个学科门类，有5个一级学科硕士学位授权点、43个二级学科硕士学位授权点。2017年,药学获得贵州省国内一流建设学科、临床医学获得贵州省区域内一流建设学科。
学校以药理学国家重点（培育）学科、特色民族药教育部国际合作联合实验室、基础药理教育部重点实验室等科研平台为依托，近五年，承担各级科研项目2351项，其中国家自然科学基金项目资助232项。国家自然科学基金项目资助数10年中有9年在贵州省高校中位居第二。连续3年获得贵州省科技进步奖一等奖共3项（全省共11项）。学校图书馆藏书131.84万册，电子图书105.33万种，为教育部科技查新工作站（Y03）。目前，临床医学、药学类等11个专业(类)在贵州省内实现一本招生，3个专业在省外一本招生。近三年，学校毕业生年终就业率均保持在95%以上。
学校重视对外交流与合作，1999年至今与上海交通大学、上海中医药大学、重庆医科大学等高校联合培养博士研究生。与美国、澳大利亚、马来西亚、中国台湾等近30个国家和地区高水平大学及科研机构建立了长期合作关系,开展深层次的科研合作。大力发展留学生教育，国际影响力不断提升。
站在新的历史起点上，全体师生员工秉承“明德笃学，求是致用”的校训，弘扬“信念坚定，顾全大局，顽强拼搏，严谨治学，开拓创新”的遵医精神，坚持内涵发展，为建成西部一流的教学研究型医科大学而努力奋斗。