牡丹江医学院是黑龙江省东南部地区唯一一所省属普通本科医药院校。学校创建于1958年，著名历史学家郭沫若先生题写了校名。学校历经了牡丹江医学院（1958—1962年）、牡丹江卫生学校（1962—1978年）、牡丹江医学专科学校（1978—1986年）、牡丹江医学院（1986年至今）等历史时期。2010年被列为黑龙江省特色应用型本科高校建设单位。2012年被评为全国首批卓越医生教育培训计划项目试点高校。2013年获得硕士学位授予权。2015年，在教育部临床医学专业认证中获得了6年有效期，居地方医学院校领先水平。
  学校本科招生面向全国27个省、自治区、直辖市，现有全日制硕士研究生、本科生10625人。学校开设临床医学、医学影像技术、制药工程、公共事业管理等20个本科专业，涵盖医学、理学、工学和管理学4个学科门类。其中临床医学、医学影像学、麻醉学、医学检验是省级重点专业，医学影像学是省级一类特色专业、国家级一类特色专业建设点和省人才培养模式创新实验区，口腔医学专业列为本科一表招生。临床医学、基础医学、生物学和护理学为硕士学λ授权一级学科。基础医学、生物学、内科学和影像医学与核医学为省级重点学科；药学和外科学为省级重点培育学科。人体解剖学、组织学与胚胎学、医学遗传学、病原生物学、医学影像设备学和诊断学为省级精品资源共享课程。
建校以来，学校共培养医学、药学等专业毕业生5万余人，他们活跃在祖国的医药卫生战线，大部分已经成为学科带头人和业务骨干，为黑龙江省和全国医药卫生事业发展作出了重要贡献。