安徽中医药高等专科学校前身是始建于1960年的“芜湖市中医学校”。2001年，学校独立升格并于次年经教育部批准，在全国同类院校率先更名为“安徽中医药高等专科学校”。为整合卫生教育资源，壮大学校实力，2006年，市政府将芜湖市中医医院成建制划归学校作为直属附属医院；2012年，附属市牙病防治所成功创建附属口腔医院（芜湖市口腔医院）。经过50多年的建设与发展，学校已经成为具有鲜明中医药特色的地方性高等院校，2010年，学校成功创建了“安徽省示范性高等职业院校”；2015年，学校在省级示范性高职院校项目验收和人才培养工作个性化评估中获得“优秀”等次。
  学校占地面积997亩，总建筑面积29.7万平方米，现有医疗系、药学系、康复保健系、护理系、口腔医学系及基础教学部、思想政治理论课教学研究部等教学系部，开办中医学、中医骨伤、针灸推拿、中药学、药学、护理、中医健康管理、中医养生保健（含中医养生旅游方向）、医疗美容技术、口腔技术、康复治疗技术等29个专科专业及专业方向，学校现有专任教师553人，其中，副高以上专业技术人员192人，具有研究生学历人员246人，省级优秀教师3人，学校还聘任国医大师李济仁、长江学者叶文才为特聘教授、客座教授。
  学校下辖2所直属附属医院、1个安徽中药资源研究所、1个天然药用植物园和9所非直属附属医院及稳定的实习基地120家。学校附属中医医院（芜湖市中医医院）创立于1958年，在中医界素有“江南中医一枝花”的美誉，为“全国首批示范中医院”、“国家三级甲等中医医院”，医院拥有4个国家级重点专科，6个省级重点专科, 7个市级重点专科，1个省级重点专病，国家级名老中医工作室4个，省级名老中医工作室4个。
  建校50余年来，特别是升格近15年来，学校秉承“厚德、博学、济世、日新”的校训，坚持“以人为本、尚德重技，创新服务，特色发展”的办学理念，在中医药专业建设、应用型人才培养、中医药对外交流、中医药健康产业研发以及服务地方经济和社会发展等方面，形成了独特的优势，为国家培养了5万余名中医药应用型人才。当前，学校正进一步解放思想，同心同德，抢抓机遇，科学发展，努力提高人才培养质量和提升办学层次。